Các doanh nghiệp trong KCNCS Phú Mỹ 3 được ưu đãi về thuế thu nhập doanh nghiệp như sau:
- 17% trên thu nhập chịu thuế cho 10 năm đầu tiên kể từ năm có doanh thu theo Nghị định số 118/2015/NĐ-CP & Nghị định số 218/2013/NĐ-CP của Chính phủ.
- Miễn thuế 2 năm đầu tiên kể từ năm có thu nhập chịu thuế, và giảm 50% cho 4 năm tiếp theo, sau khi dự án đầu tư mới có thu nhập chịu thuế theo như Nghị định số 218/2013/NĐ-CP của Chính phủ.